Ως απόσταγμα της ιστορικής και ετυμολογικής αναζήτησης, αξίζει να αναφερθεί ότι οι ρίζες της ονομασίας του χωριού μας φαίνεται να εκτείνονται βαθιά στην αρχαιότητα. Στην περιοχή Ομάνα, τα Σκουλούφια φιλοξενούν ένα από τα λιγότερο γνωστά Ασκληπιεία της Κρήτης, στοιχείο που συνδέει τον τόπο με μια μακραίωνη πολιτιστική και θεραπευτική παράδοση.
Το εύγλωττο τοπωνύμιο «Σκουλούφια» εικάζεται ότι προέρχεται μέσα από τη γλωσσική εξέλιξη της ονομασίας Aesculapia → Sculapia → Skouloufia, εκδοχή που συνδέει άμεσα το χωριό με την αρχαία λατρεία του Ασκληπιού.
Δεν θεωρείται τυχαία η άμεση γειτνίαση του χωριού με τον αρχαιολογικό χώρο της Αρχαίας Ελεύθερνας, της οποίας πολιούχος ήταν ο θεραπευτής Απόλλων, πατέρας του Ασκληπιού. Συχνά, άλλωστε, η αρχαιολογική έρευνα φέρνει στο φως, δίπλα σε ιερά του Απόλλωνα, χώρους αφιερωμένους στον Ασκληπιό, μια συνύπαρξη που μαρτυρεί τη βαθιά λατρευτική και θεραπευτική τους σχέση.
Δεν είναι επίσης τυχαίο ότι πολιούχος του χωριού μας είναι ο Σωτήρας Χριστός. «Σωτήρ» υπήρξε προσωνύμιο και του Ασκληπιού, υποδηλώνοντας τον θεραπευτή και λυτρωτή του ανθρώπινου πόνου.
Έτσι, μέσα από τη διαδοχή των αιώνων, το όνομα των Σκουλουφίων μοιάζει να διαφυλάσσει μια μνήμη θεραπείας, πίστης και συνέχειας· έναν ζωντανό σύνδεσμο ανάμεσα στην αρχαιότερη κληρονομιά και τη νεότερη ιστορία του τόπου μας.